Ilhas Galápagos

Foi lá que Darwin constatou a existência de espécies de árvores,tartarugas e aves diferentes em cada ilha.
Foi em Galápagos que Darwin realmente passou a duvidar da imutabilidade das espécies, principalmente após as observações realizadas.
Alguns autores comentam que durante um jantar na casa do Governador de Galápagos, surgiram comentários sobre a possibilidade de reconhecer a procedência dos galápagos (cágados) a partir da forma casco.
Posteriormente, no navio, ao preparar os espécimes coletados para armazenamento e com a ajuda das anotações do Capitão Fitzroy verificou a variação existente entre os tentilhões em relação as diferentes ilhas do Arquipélago de Galápagos. Nas figuras ao lado pode-se reparar na forma dos cascos dos cágados

Costa Oeste da América do Sul

Lá o Beagle parou para fazer levantamentos no Arquipélago de los Chonos. Dali eles viram a erupção do vulcão Osorno nos Andes. Eles então partiram para o norte chegando ao porto de Valdivia em 20 de fevereiro de 1835. Darwin estava em terra firme quando experiênciou um terremoto, e retornou para encontrar o porto da cidade severamente destruido. A 320 km dali em Concepción, Chile, eles encontraram a cidade devastada por repetidos choques e ondas de mare, deixando até a catedral da cidade em ruínas. Tentando fugir do horror da morte e destruição da cena, Darwin notou que as camadas de mexilhões estavam depositadas acima da maré alta com os moluscos mortos . Havia evidências claras de que o chão havia elevado-se 2,7m, e ele pessoalmente experimentou o processo gradual do continente emergindo do oceano como Lyell havia indicado.
De volta a Valparaiso, Darwin participou de outra excursão para os Andes em 21 de março alcançando a divisão continental a 4000m de altura: até ali ele encontrou fósseis de conchas do mar nas rochas. Depois de ir a Mendoza quando estavam retornando por uma passagem diferente eles encontraram uma floresta petrificada de árvores fossilizadas, cristalizadas em uma escarpa de arenito. Darwin percebeu que essas árvores estavam na praia atlântica quando a terra afundou, enterrando-as na areia que foi então comprimida em rocha, e foi então gradualmente elevada junto com o continente a 2100m nas montanhas. Retornando a Valparaiso com mulas carregadas de espécimes ele escreveu a seu pai que seus achados, se aceitos, seriam cruciais para a teoria da formação do mundo. Após outra expedição aos Andes enquanto o Beagle estava sendo consertado, Darwin finalmente se juntou ao resto da expedição e eles velejaram para Lima, mas encontraram uma insurreição em progresso e tiveram que permanecer no navio. Nessa ocasião ele estava escrevendo suas notas quando percebeu que a idéia de Lyell de que atóis de corais estavam na borda de vulcões extintos que se elevavam fazia menos sentido do que vulcões afundando gradativamente para que os recifes de corais em volta da ilha continuassem sendo formados perto do nível do mar e se transformassem em atóis enquanto o vulcão desaparecia no mar. Essa era uma teoria que ele iria examinar quando eles chegassem a tais ilhas.

América do Sul

Enquanto o Beagle continuava com o seu trabalho de levantamento, navegando junto a costa, Darwin passou muito de seu tempo longe do navio. A certos intervalos, o Beagle retornava a certos portos em que a correspondência poderia ser recebida e onde as anotações, diários de Darwin e suas coleções eram mandadas de volta para Inglaterra. Darwin fez várias visitas ao continente, com companheiros de viagem das regiões que visitava. Na praia de Punta Alta em setembro de 1832 ele encontrou ossos fossilizados de mamíferos gigantes extintos. Um que ele achou que poderia vir a ser de um rinoceronte, veio a ser um Megatherium, uma preguiça gigante, e o outro foi o de um tatu gigantes, o Glyptodonte. Em novembro, na cidade de Montevidéu a correspondência que chegava da Inglaterra incluía uma cópia do segundo volume dos Princípios da Geologia de Lyell, que apresentava uma variação de Criacionismo relatando a idéia de mudança gradual, onde espécies eram criadas em “centros de Criação” e iam a extinção a medida que o ambiente mudava, para sua desvantagem.
Eles chegaram à Terra do Fogo em 1 de dezembro de 1832 e Darwin ficou perplexo com o estado de selvageria dos nativos, em grande contraste com o comportamento civilizado dos três fueguianos que eles estavam retornando como missionários. Ele descreveu seu primeiro encontro com os nativos fueguianos como sendo “sem exceção o espetaculo mais interessante e curioso que eu já tinha visto: eu não podia acreditar quão grande era a diferença entre os selvagens e os homens civilizados: era maior do que de um animal selvagem e um doméstico, visto que o homem tem um grande poder de melhoramento.”
O Beagle foi então para as Ilhas Malvinas, chegando logo depois da invasão de 1833. Darwin estudou a relação das espécies e dos habitates e encontrou fósseis antigos como os que ele encontrou em Gales. Fitzroy trouxe uma escuna para ajudar no levantamento. Eles retornaram a Patagônia, onde a escuna foi provida com uma superfície inferior de cobre e rebatizado de Adventure (Aventura). Darwin foi assistido em preservar espécimes, por um jovem marinheiro chamado Syms Covington.
Durante a viagem pela América do Sul, Darwin estudou a diversidade de emas nos pampas, e além disso encontrou ossos gigantes de um possível ancestral das capivaras, a qual mandou também para a Inglaterra

Hora de partir

O Beagle não estava pronto para velejar até o início de Novembro, e foi então repetidamente atrasado por ventos fortes, zarpando só em 27 de dezembro de 1831. Passou pela Ilha da Madeira (mas não aportou nela) indo então para Tenerife, mas proibido de desembarcar por causa da quarentena de cólera imposta a barcos vindo da Inglaterra. Eles fizeram sua primeira parada na ilha vulcânica de Santiago no Arquipélago do Cabo Verde, (onde o Diário de Darwin começa). Enquanto leituras precisas eram feitas para confirmar dados sobre a longitude, ele foi à praia e ficou fascinado com sua primeira visão da vegetação tropical, e da geologia do lugar, analisando uma faixa branca bem elevada de conchas do mar, dando suporte a teses de Lyell da elevação e queda da crosta da Terra.
Depois de passar por várias outras ilhas eles chegaram à Bahia(Salvador), Brasil em 29 de fevereiro, onde Darwin ficou maravilhado com a floresta tropical. A visão da escravidão foi considerada ofensiva por Darwin. Ao retrucar isso a FitzRoy quando ele disse que a mesma era justificável, fez com que FitzRoy perdesse a calma e o baniu da expedição. Os oficiais do barco apelidaram o capitão de “hot coffe” (café quente) devido ao seu temperamento na situação, e após algumas horas ele pediu desculpas a Darwin e pediu para que ele permanecesse na expedição.
Darwin ia fazendo sua coleção de especimes, as quais mandava para Cambridge , ao invés de fazer coleções para a expedição em si.

Um pouco de como tudo começou...

As expedições anteriores de levantamento destinados a América do Sul envolveram o HMS Adventure e o HMS Beagle sob o comando geral do comandante australiano Philip Parker King. Durante o levantamento o capitão da Beagle, Pringle Stokes, cometeu suicídio e seu comando foi transferido para o jovem aristocrata Robert FitzRoy (ao lado).

Após o retorno da expedição em 14 de outubro de 1830 capitão King se aposentou, e em 25 de junho de 1831, FitzRoy com 26 anos foi apontado como líder de uma segunda expedição comandando o Beagle. Ele não poupou despesas nos reparos e melhorias do Beagle, com o levantamento do convés e a instalação do melhor e mais recentes equipamentos de navegação. FitzRoy queria um companheiro de viagem bem educado e com conhecimentos cientificos para acompanhá-lo em uma das expedições. Darwin, então com 22 anos foi indicado para a ocupação da vaga por conhecidos de FitzRoy. Porém, as desespesas eram todas pagas pelo próprio naturalista, e o pai de Darwin financiou a viagem do filho.

Darwin ficou responsável então de obter seu próprio equipamento e de meios de preservar suas especimes.

Diversidade

Na américa do sul, ele descobriu fósseis de animais extintos como o megaterium e o gliptodonte em camadas que não mostrava qualquer sinal de catástrofe ou mudanças climáticas.

Naquele tempo, ele pensava que aquelas eram espécies similares aquelas encontradas na África, mas na verdade os fósseis encontrados eram mais similares a animais não extintos que viviam na mesma região (tatus e preguiças).

Nas ilhas Galápagos, Darwin descobriu que cada espécie de cotovia era diferente de uma ilha para outra. E o mesmo ocorria com tartarugas e tentilhões.

O rato-canguru, e o ornitorrinco eram animais tão estranhos que fizeram Darwin pensar " Um incrédulo, poderia dizer que seguramente dois criadores diferentes estiveram em ação"

O Beagle e sua estrutura

O navio foi construído segundo o plano da chamada classe Cherokee, cognominada de "brigues caixão", dada a notória tendência daqueles navios para adornarem excessivamente. Dos 107 navios construídos segundo aquele projecto, 27 perderam-se no mar. Apesar disso, a classe Cherokee foi uma das configurações mais vezes construídas pela Marinha Real Britânica.